Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATXN3P54252 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATXN3P54252 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms