Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRISP3P54108 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRISP3P54108 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRISP3P54108 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.9 ms