Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GTF2A1P52655 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2A1P52655 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2A1P52655 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms