Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR4P51679 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR4P51679 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR4P51679 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR4P51679 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR4P51679 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR4P51679 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR4P51679 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR4P51679 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR4P51679 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR4P51679 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR4P51679 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCR4P51679 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCR4P51679 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR4P51679 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR4P51679 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR4P51679 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR4P51679 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCR4P51679 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR4P51679 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR4P51679 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCR4P51679 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCR4P51679 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR4P51679 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR4P51679 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR4P51679 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCR4P51679 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR4P51679 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR4P51679 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR4P51679 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR4P51679 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCR4P51679 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR4P51679 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCR4P51679 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR4P51679 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR4P51679 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR4P51679 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR4P51679 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCR4P51679 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR4P51679 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR4P51679 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR4P51679 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR4P51679 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCR4P51679 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR4P51679 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR4P51679 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR4P51679 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR4P51679 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR4P51679 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCR4P51679 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCR4P51679 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR4P51679 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR4P51679 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR4P51679 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR4P51679 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCR4P51679 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCR4P51679 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms