Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBP50607 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBP50607 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBP50607 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBP50607 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBP50607 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBP50607 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBP50607 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBP50607 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBP50607 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBP50607 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBP50607 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBP50607 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBP50607 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBP50607 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBP50607 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBP50607 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBP50607 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBP50607 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBP50607 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBP50607 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBP50607 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBP50607 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBP50607 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBP50607 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBP50607 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBP50607 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBP50607 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBP50607 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBP50607 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBP50607 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBP50607 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBP50607 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBP50607 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBP50607 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBP50607 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBP50607 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBP50607 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBP50607 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBP50607 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBP50607 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBP50607 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBP50607 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBP50607 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBP50607 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBP50607 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBP50607 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBP50607 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBP50607 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBP50607 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBP50607 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBP50607 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBP50607 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBP50607 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBP50607 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.3 ms