Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX5P50542 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX5P50542 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX5P50542 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX5P50542 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX5P50542 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX5P50542 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX5P50542 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX5P50542 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX5P50542 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX5P50542 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX5P50542 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX5P50542 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX5P50542 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX5P50542 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX5P50542 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PEX5P50542 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX5P50542 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX5P50542 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX5P50542 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX5P50542 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX5P50542 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX5P50542 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX5P50542 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX5P50542 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX5P50542 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX5P50542 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX5P50542 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX5P50542 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX5P50542 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX5P50542 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX5P50542 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX5P50542 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX5P50542 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX5P50542 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX5P50542 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PEX5P50542 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX5P50542 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX5P50542 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX5P50542 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX5P50542 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PEX5P50542 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PEX5P50542 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX5P50542 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX5P50542 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PEX5P50542 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX5P50542 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX5P50542 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX5P50542 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX5P50542 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX5P50542 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX5P50542 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PEX5P50542 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX5P50542 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX5P50542 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX5P50542 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX5P50542 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX5P50542 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PEX5P50542 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX5P50542 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PEX5P50542 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PEX5P50542 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX5P50542 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX5P50542 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX5P50542 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX5P50542 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX5P50542 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PEX5P50542 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms