Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRIP1P50238 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRIP1P50238 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms