Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK3P49761 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK3P49761 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK3P49761 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLK3P49761 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK3P49761 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLK3P49761 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK3P49761 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK3P49761 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK3P49761 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK3P49761 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK3P49761 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK3P49761 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLK3P49761 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLK3P49761 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLK3P49761 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK3P49761 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK3P49761 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK3P49761 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK3P49761 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK3P49761 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLK3P49761 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLK3P49761 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLK3P49761 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLK3P49761 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK3P49761 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK3P49761 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK3P49761 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLK3P49761 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK3P49761 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK3P49761 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK3P49761 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK3P49761 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLK3P49761 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLK3P49761 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLK3P49761 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLK3P49761 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK3P49761 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK3P49761 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK3P49761 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK3P49761 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK3P49761 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLK3P49761 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK3P49761 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms