Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK1P49759 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK1P49759 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLK1P49759 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK1P49759 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK1P49759 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK1P49759 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK1P49759 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK1P49759 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLK1P49759 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK1P49759 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLK1P49759 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLK1P49759 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK1P49759 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK1P49759 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLK1P49759 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK1P49759 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK1P49759 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK1P49759 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK1P49759 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK1P49759 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK1P49759 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK1P49759 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK1P49759 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLK1P49759 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK1P49759 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK1P49759 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK1P49759 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK1P49759 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK1P49759 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK1P49759 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK1P49759 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK1P49759 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK1P49759 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK1P49759 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK1P49759 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK1P49759 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK1P49759 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK1P49759 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK1P49759 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK1P49759 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK1P49759 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK1P49759 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK1P49759 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLK1P49759 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLK1P49759 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLK1P49759 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK1P49759 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLK1P49759 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms