Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRIM2P49643 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRIM2P49643 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRIM2P49643 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms