Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PXNP49023 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXNP49023 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXNP49023 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXNP49023 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXNP49023 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PXNP49023 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PXNP49023 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXNP49023 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXNP49023 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXNP49023 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PXNP49023 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXNP49023 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXNP49023 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXNP49023 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXNP49023 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PXNP49023 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXNP49023 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXNP49023 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXNP49023 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PXNP49023 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXNP49023 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXNP49023 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXNP49023 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXNP49023 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PXNP49023 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXNP49023 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXNP49023 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXNP49023 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PXNP49023 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXNP49023 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXNP49023 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PXNP49023 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PXNP49023 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PXNP49023 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXNP49023 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PXNP49023 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXNP49023 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXNP49023 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXNP49023 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXNP49023 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXNP49023 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXNP49023 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PXNP49023 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PXNP49023 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PXNP49023 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PXNP49023 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PXNP49023 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PXNP49023 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PXNP49023 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PXNP49023 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PXNP49023 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PXNP49023 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PXNP49023 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PXNP49023 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PXNP49023 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PXNP49023 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PXNP49023 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PXNP49023 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PXNP49023 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PXNP49023 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PXNP49023 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PXNP49023 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PXNP49023 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PXNP49023 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PXNP49023 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PXNP49023 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PXNP49023 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PXNP49023 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PXNP49023 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PXNP49023 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PXNP49023 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PXNP49023 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PXNP49023 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PXNP49023 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PXNP49023 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PXNP49023 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PXNP49023 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PXNP49023 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PXNP49023 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PXNP49023 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.4 ms