Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSNK1A1P48729 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSNK1A1P48729 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSNK1A1P48729 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSNK1A1P48729 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms