Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX9P48436 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX9P48436 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX9P48436 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX9P48436 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX9P48436 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX9P48436 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX9P48436 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX9P48436 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX9P48436 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX9P48436 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX9P48436 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX9P48436 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX9P48436 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX9P48436 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX9P48436 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX9P48436 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX9P48436 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX9P48436 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX9P48436 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX9P48436 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX9P48436 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX9P48436 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX9P48436 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX9P48436 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX9P48436 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX9P48436 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX9P48436 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX9P48436 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX9P48436 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX9P48436 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX9P48436 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX9P48436 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX9P48436 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX9P48436 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX9P48436 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX9P48436 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX9P48436 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX9P48436 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX9P48436 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX9P48436 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX9P48436 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX9P48436 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX9P48436 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX9P48436 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX9P48436 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX9P48436 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX9P48436 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX9P48436 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX9P48436 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX9P48436 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX9P48436 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms