Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFX2P48378 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFX2P48378 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFX2P48378 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFX2P48378 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFX2P48378 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFX2P48378 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFX2P48378 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFX2P48378 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFX2P48378 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFX2P48378 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFX2P48378 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFX2P48378 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFX2P48378 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFX2P48378 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFX2P48378 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFX2P48378 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFX2P48378 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFX2P48378 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFX2P48378 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFX2P48378 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFX2P48378 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFX2P48378 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFX2P48378 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RFX2P48378 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RFX2P48378 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RFX2P48378 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RFX2P48378 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RFX2P48378 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFX2P48378 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFX2P48378 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFX2P48378 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFX2P48378 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFX2P48378 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFX2P48378 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RFX2P48378 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFX2P48378 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFX2P48378 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFX2P48378 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFX2P48378 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RFX2P48378 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RFX2P48378 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms