Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC6A11P48066 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC6A11P48066 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC6A11P48066 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC6A11P48066 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC6A11P48066 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms