Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPZBP47756 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAPZBP47756 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAPZBP47756 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms