Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR2P43308 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR2P43308 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSR2P43308 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR2P43308 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR2P43308 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SSR2P43308 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR2P43308 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR2P43308 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR2P43308 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR2P43308 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR2P43308 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSR2P43308 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR2P43308 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR2P43308 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSR2P43308 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSR2P43308 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSR2P43308 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR2P43308 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR2P43308 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR2P43308 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSR2P43308 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR2P43308 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR2P43308 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSR2P43308 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR2P43308 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSR2P43308 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR2P43308 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR2P43308 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR2P43308 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR2P43308 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR2P43308 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR2P43308 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSR2P43308 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR2P43308 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR2P43308 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR2P43308 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR2P43308 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR2P43308 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSR2P43308 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR2P43308 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR2P43308 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR2P43308 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR2P43308 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR2P43308 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSR2P43308 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSR2P43308 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSR2P43308 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR2P43308 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR2P43308 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SSR2P43308 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSR2P43308 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSR2P43308 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms