Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MCAMP43121 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCAMP43121 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCAMP43121 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCAMP43121 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCAMP43121 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCAMP43121 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCAMP43121 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCAMP43121 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MCAMP43121 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCAMP43121 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCAMP43121 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCAMP43121 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCAMP43121 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCAMP43121 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCAMP43121 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCAMP43121 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCAMP43121 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCAMP43121 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCAMP43121 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCAMP43121 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCAMP43121 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCAMP43121 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCAMP43121 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCAMP43121 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCAMP43121 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCAMP43121 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCAMP43121 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MCAMP43121 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MCAMP43121 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCAMP43121 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCAMP43121 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCAMP43121 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCAMP43121 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCAMP43121 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCAMP43121 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCAMP43121 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MCAMP43121 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCAMP43121 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCAMP43121 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCAMP43121 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCAMP43121 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCAMP43121 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCAMP43121 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCAMP43121 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCAMP43121 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCAMP43121 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MCAMP43121 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCAMP43121 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCAMP43121 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCAMP43121 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCAMP43121 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCAMP43121 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCAMP43121 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCAMP43121 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCAMP43121 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCAMP43121 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCAMP43121 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MCAMP43121 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCAMP43121 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCAMP43121 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCAMP43121 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCAMP43121 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCAMP43121 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCAMP43121 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MCAMP43121 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCAMP43121 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCAMP43121 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
MCAMP43121 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCAMP43121 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCAMP43121 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MCAMP43121 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCAMP43121 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MCAMP43121 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCAMP43121 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCAMP43121 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCAMP43121 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCAMP43121 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCAMP43121 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCAMP43121 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCAMP43121 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCAMP43121 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCAMP43121 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCAMP43121 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCAMP43121 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCAMP43121 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCAMP43121 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCAMP43121 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms