Protein–RNA interactions for Protein: P42773

CDKN2C, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2CP42773 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2CP42773 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2CP42773 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2CP42773 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2CP42773 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms