Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTRLP40313 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTRLP40313 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTRLP40313 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTRLP40313 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTRLP40313 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTRLP40313 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTRLP40313 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTRLP40313 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTRLP40313 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTRLP40313 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTRLP40313 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTRLP40313 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTRLP40313 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTRLP40313 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTRLP40313 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTRLP40313 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTRLP40313 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTRLP40313 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTRLP40313 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTRLP40313 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTRLP40313 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTRLP40313 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTRLP40313 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTRLP40313 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTRLP40313 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTRLP40313 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTRLP40313 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTRLP40313 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTRLP40313 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTRLP40313 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTRLP40313 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTRLP40313 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTRLP40313 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTRLP40313 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTRLP40313 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTRLP40313 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTRLP40313 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTRLP40313 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTRLP40313 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTRLP40313 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTRLP40313 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTRLP40313 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTRLP40313 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTRLP40313 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTRLP40313 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTRLP40313 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms