Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FEN1P39748 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FEN1P39748 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FEN1P39748 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FEN1P39748 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FEN1P39748 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FEN1P39748 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FEN1P39748 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FEN1P39748 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FEN1P39748 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FEN1P39748 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FEN1P39748 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FEN1P39748 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FEN1P39748 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FEN1P39748 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FEN1P39748 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FEN1P39748 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FEN1P39748 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FEN1P39748 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FEN1P39748 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FEN1P39748 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FEN1P39748 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FEN1P39748 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FEN1P39748 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FEN1P39748 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FEN1P39748 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FEN1P39748 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FEN1P39748 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FEN1P39748 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FEN1P39748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FEN1P39748 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FEN1P39748 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FEN1P39748 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FEN1P39748 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FEN1P39748 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FEN1P39748 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FEN1P39748 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FEN1P39748 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FEN1P39748 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FEN1P39748 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FEN1P39748 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FEN1P39748 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FEN1P39748 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FEN1P39748 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FEN1P39748 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FEN1P39748 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FEN1P39748 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FEN1P39748 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.4 ms