Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATP7BP35670 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATP7BP35670 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ATP7BP35670 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7BP35670 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7BP35670 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms