Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXD13P35453 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXD13P35453 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXD13P35453 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXD13P35453 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms