Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCVRNP35243 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RCVRNP35243 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCVRNP35243 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms