Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKARP32238 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKARP32238 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKARP32238 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCKARP32238 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKARP32238 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKARP32238 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKARP32238 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCKARP32238 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKARP32238 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKARP32238 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKARP32238 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKARP32238 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCKARP32238 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKARP32238 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKARP32238 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCKARP32238 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKARP32238 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKARP32238 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKARP32238 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKARP32238 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKARP32238 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKARP32238 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCKARP32238 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKARP32238 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKARP32238 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKARP32238 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKARP32238 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKARP32238 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCKARP32238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCKARP32238 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCKARP32238 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCKARP32238 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCKARP32238 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCKARP32238 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCKARP32238 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCKARP32238 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCKARP32238 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCKARP32238 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCKARP32238 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCKARP32238 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCKARP32238 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCKARP32238 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCKARP32238 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCKARP32238 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCKARP32238 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCKARP32238 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCKARP32238 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCKARP32238 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCKARP32238 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCKARP32238 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCKARP32238 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCKARP32238 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCKARP32238 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCKARP32238 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCKARP32238 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCKARP32238 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCKARP32238 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCKARP32238 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCKARP32238 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCKARP32238 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCKARP32238 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCKARP32238 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms