Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EPHA2P29317 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EPHA2P29317 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.6 ms