Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1P29120 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK1P29120 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCSK1P29120 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK1P29120 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms