Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR1EP28566 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1EP28566 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1EP28566 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms