Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD27P26842 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD27P26842 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CD27P26842 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD27P26842 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD27P26842 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CD27P26842 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD27P26842 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD27P26842 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD27P26842 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD27P26842 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD27P26842 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD27P26842 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD27P26842 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD27P26842 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD27P26842 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CD27P26842 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD27P26842 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD27P26842 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD27P26842 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD27P26842 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD27P26842 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD27P26842 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD27P26842 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD27P26842 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD27P26842 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD27P26842 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD27P26842 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD27P26842 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD27P26842 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD27P26842 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD27P26842 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD27P26842 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD27P26842 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD27P26842 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD27P26842 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD27P26842 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD27P26842 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD27P26842 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD27P26842 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD27P26842 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD27P26842 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD27P26842 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD27P26842 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD27P26842 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD27P26842 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD27P26842 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD27P26842 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD27P26842 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD27P26842 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD27P26842 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD27P26842 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD27P26842 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD27P26842 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD27P26842 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CD27P26842 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD27P26842 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD27P26842 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD27P26842 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD27P26842 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD27P26842 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD27P26842 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD27P26842 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CD27P26842 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD27P26842 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD27P26842 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD27P26842 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD27P26842 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD27P26842 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD27P26842 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD27P26842 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD27P26842 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD27P26842 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CD27P26842 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD27P26842 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD27P26842 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD27P26842 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD27P26842 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD27P26842 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD27P26842 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD27P26842 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD27P26842 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD27P26842 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD27P26842 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD27P26842 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms