Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
DNMT1P26358 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
DNMT1P26358 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
DNMT1P26358 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
DNMT1P26358 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
DNMT1P26358 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms