Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP5F1P24539 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP5F1P24539 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5F1P24539 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms