Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP24386 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP24386 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP24386 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP24386 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP24386 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP24386 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP24386 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP24386 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP24386 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP24386 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP24386 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP24386 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP24386 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP24386 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP24386 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP24386 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP24386 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP24386 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP24386 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP24386 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP24386 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP24386 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP24386 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP24386 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP24386 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP24386 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP24386 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP24386 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP24386 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP24386 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP24386 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP24386 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP24386 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP24386 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP24386 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP24386 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP24386 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP24386 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP24386 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP24386 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP24386 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP24386 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP24386 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP24386 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP24386 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP24386 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP24386 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP24386 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP24386 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP24386 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP24386 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP24386 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP24386 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP24386 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP24386 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP24386 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP24386 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP24386 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP24386 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP24386 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP24386 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP24386 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP24386 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP24386 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP24386 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP24386 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP24386 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP24386 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP24386 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP24386 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP24386 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP24386 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP24386 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP24386 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP24386 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP24386 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP24386 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP24386 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP24386 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP24386 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP24386 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP24386 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP24386 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP24386 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms