Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP11P24347 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP11P24347 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP11P24347 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MMP11P24347 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP11P24347 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP11P24347 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP11P24347 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP11P24347 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP11P24347 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP11P24347 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MMP11P24347 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP11P24347 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP11P24347 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP11P24347 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP11P24347 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP11P24347 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MMP11P24347 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP11P24347 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP11P24347 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP11P24347 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP11P24347 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP11P24347 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MMP11P24347 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP11P24347 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP11P24347 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP11P24347 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP11P24347 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP11P24347 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MMP11P24347 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP11P24347 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MMP11P24347 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MMP11P24347 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP11P24347 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP11P24347 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP11P24347 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP11P24347 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP11P24347 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP11P24347 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP11P24347 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP11P24347 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP11P24347 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP11P24347 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP11P24347 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP11P24347 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP11P24347 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP11P24347 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP11P24347 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP11P24347 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP11P24347 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP11P24347 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP11P24347 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP11P24347 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP11P24347 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP11P24347 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP11P24347 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP11P24347 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP11P24347 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP11P24347 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP11P24347 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP11P24347 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP11P24347 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP11P24347 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP11P24347 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP11P24347 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP11P24347 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP11P24347 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP11P24347 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP11P24347 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP11P24347 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP11P24347 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP11P24347 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms