Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPH2P23942 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPH2P23942 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPH2P23942 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms