Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EIF4BP23588 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF4BP23588 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms