Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHBP21912 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHBP21912 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHBP21912 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SDHBP21912 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDHBP21912 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDHBP21912 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDHBP21912 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDHBP21912 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDHBP21912 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHBP21912 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHBP21912 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHBP21912 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDHBP21912 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHBP21912 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHBP21912 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHBP21912 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHBP21912 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDHBP21912 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDHBP21912 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDHBP21912 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDHBP21912 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHBP21912 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHBP21912 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHBP21912 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHBP21912 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDHBP21912 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHBP21912 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHBP21912 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHBP21912 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHBP21912 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHBP21912 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SDHBP21912 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHBP21912 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHBP21912 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHBP21912 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHBP21912 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHBP21912 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDHBP21912 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDHBP21912 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHBP21912 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHBP21912 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHBP21912 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHBP21912 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHBP21912 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDHBP21912 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDHBP21912 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHBP21912 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHBP21912 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHBP21912 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHBP21912 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHBP21912 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDHBP21912 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDHBP21912 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDHBP21912 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDHBP21912 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDHBP21912 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDHBP21912 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHBP21912 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHBP21912 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHBP21912 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHBP21912 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDHBP21912 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHBP21912 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHBP21912 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHBP21912 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHBP21912 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHBP21912 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHBP21912 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDHBP21912 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDHBP21912 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDHBP21912 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDHBP21912 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHBP21912 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDHBP21912 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDHBP21912 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHBP21912 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHBP21912 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDHBP21912 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHBP21912 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHBP21912 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHBP21912 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHBP21912 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDHBP21912 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms