Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB4AP20338 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB4AP20338 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms