Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN1P20061 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN1P20061 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN1P20061 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN1P20061 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN1P20061 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCN1P20061 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN1P20061 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN1P20061 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN1P20061 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN1P20061 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN1P20061 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCN1P20061 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCN1P20061 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN1P20061 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN1P20061 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN1P20061 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN1P20061 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCN1P20061 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN1P20061 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN1P20061 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCN1P20061 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN1P20061 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN1P20061 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCN1P20061 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN1P20061 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN1P20061 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN1P20061 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN1P20061 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN1P20061 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCN1P20061 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN1P20061 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN1P20061 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN1P20061 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN1P20061 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCN1P20061 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TCN1P20061 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCN1P20061 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN1P20061 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN1P20061 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN1P20061 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN1P20061 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCN1P20061 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCN1P20061 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCN1P20061 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms