Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2B1P20020 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B1P20020 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B1P20020 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B1P20020 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B1P20020 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B1P20020 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2B1P20020 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B1P20020 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B1P20020 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B1P20020 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B1P20020 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2B1P20020 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B1P20020 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B1P20020 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B1P20020 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2B1P20020 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B1P20020 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B1P20020 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B1P20020 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2B1P20020 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP2B1P20020 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B1P20020 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B1P20020 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B1P20020 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP2B1P20020 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B1P20020 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms