Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF6P18850 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF6P18850 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF6P18850 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF6P18850 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF6P18850 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATF6P18850 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF6P18850 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF6P18850 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF6P18850 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF6P18850 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF6P18850 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATF6P18850 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATF6P18850 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6P18850 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6P18850 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6P18850 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6P18850 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6P18850 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATF6P18850 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF6P18850 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF6P18850 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATF6P18850 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF6P18850 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF6P18850 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF6P18850 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF6P18850 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF6P18850 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATF6P18850 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF6P18850 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF6P18850 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATF6P18850 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF6P18850 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF6P18850 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF6P18850 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF6P18850 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATF6P18850 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF6P18850 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF6P18850 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATF6P18850 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF6P18850 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF6P18850 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATF6P18850 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF6P18850 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF6P18850 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF6P18850 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF6P18850 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATF6P18850 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6P18850 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6P18850 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6P18850 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6P18850 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATF6P18850 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATF6P18850 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATF6P18850 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF6P18850 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF6P18850 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF6P18850 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF6P18850 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF6P18850 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF6P18850 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms