Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEBPBP17676 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEBPBP17676 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEBPBP17676 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEBPBP17676 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms