Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN2P17655 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN2P17655 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN2P17655 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN2P17655 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CAPN2P17655 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN2P17655 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN2P17655 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN2P17655 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN2P17655 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN2P17655 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN2P17655 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN2P17655 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAPN2P17655 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN2P17655 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN2P17655 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CAPN2P17655 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN2P17655 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN2P17655 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN2P17655 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms