Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOLR1P15328 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOLR1P15328 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOLR1P15328 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms