Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC130P13994 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC130P13994 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms