Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC5A1P13866 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC5A1P13866 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC5A1P13866 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms