Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DEFA4P12838 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DEFA4P12838 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms