Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFP11831 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRFP11831 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRFP11831 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRFP11831 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRFP11831 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRFP11831 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFP11831 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFP11831 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFP11831 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRFP11831 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFP11831 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFP11831 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFP11831 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRFP11831 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRFP11831 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRFP11831 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRFP11831 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRFP11831 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRFP11831 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRFP11831 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRFP11831 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFP11831 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFP11831 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFP11831 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFP11831 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFP11831 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRFP11831 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFP11831 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFP11831 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFP11831 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFP11831 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFP11831 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFP11831 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRFP11831 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFP11831 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFP11831 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFP11831 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFP11831 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFP11831 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFP11831 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRFP11831 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFP11831 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFP11831 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFP11831 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFP11831 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRFP11831 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFP11831 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFP11831 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFP11831 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRFP11831 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRFP11831 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFP11831 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFP11831 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFP11831 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRFP11831 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRFP11831 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRFP11831 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SRFP11831 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms