Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APELAP0DMC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APELAP0DMC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APELAP0DMC3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms