Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RGPD2P0DJD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RGPD2P0DJD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
RGPD2P0DJD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
RGPD2P0DJD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RGPD2P0DJD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms