Protein–RNA interactions for Protein: P0CG36

CFC1B, Cryptic family protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1BP0CG36 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CFC1BP0CG36 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFC1BP0CG36 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms